El exdirectivo tuvo diversos episodios polémicos en la Liga MX
Jorge Vergara llegó al futbol mexicano en el 2002, y lo revolucionó. Su forma de comprar a Chivas, de manejarlas y hasta publicitarlas, llamó la atención de todos por lo que sus escándalos son bien recordados.
LOS TÉCNICOSDe 2002 hasta 2019, Jorge Vergara cambió a más de 23 entrenadores. Su slogan de campaña fue que traería a Chivas al «mejor técnico del mundo» y llegó Eduardo de la Torre. De ahí han pasado de todo, de muchas nacionalidades y muchos estilos.
Daniel Guzmán, Eduardo de la Torre, Hans Westerhof, Benjamín Galindo, Juan Carlos Ortega, Xabier Azcargorta, José Manuel de la Torre, Efraín Flores, Omar Arellano, Francisco Ramírez, Raúl Arias, José Luis Real, Fernando Quirarte, Ignacio Ambriz, Alberto Coyote, John Van´t Ship, Juan Carlos Ortega, Ricardo La Volpe, Carlos Bustos, Ramón Morales, Matías Almeyda, José Cardozo y Luis Fernando Tena.
LOS COMUNICADOSLa llegada de Vergara al futbol mexicano propició también la de los mensajes en contra de otros equipos, los famosos «comunicados». El más famoso fue el de «Me pareció ver un lindo gatito».. a lo que Ailton, jugador se Pumas, respondió con una camiseta que decía: «Gatitos ni madres»…
BODA Y DIVORCIOEn el 2008, Jorge Vergara contrajo matrimonio con Angélica Fuentes, quien era parte de una familia dedicada a la compra venta de gas natural. La llegada de Fuentes cambió la forma de trabajar en Chivas, tal fue su influencia que hasta fue accionista y directora de Chivas-Angelissima-Omnilife. Después de algunos años, en el 2015, el matrimonio llegó a su fin. Angelica Fuentes fue acusada de desfalcar al equipo, a la empresa y el club entró en una fuerte crisis económica.
PODÓLOGAEn el 2014, Ricardo La Volpe llegó a la dirección técnica del Guadalajara. Cuando todo parecía que al fin habría estabilidad en la banca de Chivas apareció el escándalo de la podóloga, donde se acusaba al argentino de haberse insinuado a la trabajadora del club. Vergara apoyó a la podóloga y despidió a La Volpe.
CHIVAS TVEn 2016 apareció Chivas TV, la plataforma por la cual los partidos del Guadalajara iban a ser vistos en todo México. Al final,Chivas TV fracasó y propició la entrada del empresario José Luis Higuera que acentuó la crisis tapatía.
DEMANDAEn el 2016, la conocida empresa fabricante de pan con un logo de osito, demandó a Chivas por incumplimiento de contrato. El caso fue a juzgados y le marca dejó de patrocinar a la camiseta de Chivas.
AMENAZA AL PIOJOEn 2017, cuando Miguel Herrera volvió a Coapa para dirigir al América, el directivo no dudó en advertirle al «Piojo» «Que se preparen mucho, porque nosotros estamos muy preparados para repetir el campeonato la temporada que entra».